Esistono molteplici ceppi di coronavirus; Ecco cosa sappiamo

Mentre COVID-19 ricopre il globo - ora avendo ufficialmente infettato oltre 800.000 persone in 179 paesi, causando oltre 39.000 morti - gli scienziati stanno seguendo una moltitudine di ceppi , secondo USA Today .

Il virus ha subito oltre un centinaio di minuscole mutazioni che agiscono come impronte genetiche, consentendo ai ricercatori di vedere come il virus sta migrando e si divide in sottotipi simili ma nuovi, che possono essere visti sul sito web NextStrain.org .

(per ulteriori informazioni su "ceppo" vs "mutazione" e perché la terminologia sta causando confusione, vedere questo thread di Trevor Bedford di NextStrain)

I laboratori di tutto il mondo stanno trasformando le loro macchine di sequenziamento, più o meno delle dimensioni di una stampante desktop, al compito di sequenziare rapidamente i genomi dei campioni di virus prelevati da persone malate di COVID-19. Le informazioni vengono caricate su un sito Web chiamato NextStrain.org che mostra come il virus sta migrando e suddividendosi in sottotipi simili ma nuovi. - USA oggi

Il frequente sequenziamento del virus ha permesso ai ricercatori di trarre diverse conclusioni; ad esempio, gli ordini di allontanamento sociale e di rifugio sul posto sembrano funzionare in alcune aree e il virus non sembra diventare più letale man mano che si evolve.

" Il virus muta così lentamente che i ceppi del virus sono fondamentalmente molto simili tra loro ", ha detto lo specialista in malattie infettive Charlies Chiu dell'Università della California, San Francisco School of Medicine. "Gli scoppi sono rintracciabili. Abbiamo la capacità di eseguire il sequenziamento genomico quasi in tempo reale per vedere quali ceppi o stirpi circolano", ha aggiunto.

Chiu ritiene inoltre che sia improbabile che la differenza nei ceppi sia responsabile del virus che colpisce le persone in modo diverso - con la maggior parte alcuni che si sentono solo leggermente sotto il tempo per un giorno o due, il 15% ha bisogno di ricovero in ospedale e un tasso di mortalità che varia a seconda del paese (e probabilmente testando le tariffe).

SARS-CoV-2, il virus che causa la malattia COVID-19, ha iniziato a circolare in Cina intorno a metà novembre o metà dicembre. Il suo genoma è composto da circa 30.000 coppie di basi , mentre un essere umano ne ha oltre 3 miliardi. Secondo il rapporto, i ceppi più divergenti del virus contengono solo 11 cambi di coppia di basi .

Finora, la maggior parte dei casi sulla costa occidentale degli Stati Uniti sono collegati a una varietà identificata per la prima volta nello stato di Washington . Potrebbe essere venuto da un uomo che era stato a Wuhan , in Cina, epicentro del virus, e tornò a casa il 15 gennaio. Sono solo tre le mutazioni del ceppo originale di Wuhan, secondo il lavoro fatto all'inizio dell'epidemia da Trevor Bedford, biologo computazionale di Fred Hutch, un centro di ricerca medica a Seattle.

Sulla costa orientale ci sono diverse tensioni, tra cui quella di Washington e altre che sembrano essersi fatte strada dalla Cina all'Europa e poi a New York e oltre , ha detto Chiu. - USA oggi

Da notare che il grande pubblico dovrebbe probabilmente lasciare agli esperti l'analisi del suddetto "albero filogenetico", poiché possono essere "un po 'pericolosi" da decifrare, secondo il professor Kristian Anderson di Scripps Research - una struttura di ricerca scientifica biomedica senza scopo di lucro a La Jolla, California.

"Questa è la prima volta che gli alberi filogenetici sono stati su Twitter", ha aggiunto, aggiungendo "Ricorda, stiamo vedendo un piccolo assaggio della pandemia molto più ampia. Abbiamo mezzo milione di casi descritti in questo momento ma forse 1.000 genomi sequenziati Quindi ci sono molti lignaggi che ci mancano ".

Anderson ha aggiunto che COVID-19 non muta molto velocemente - in effetti, è 8-10 volte più lento del virus dell'influenza e più vicino ad altri coronavirus come la sindrome respiratoria del Medio Oriente (MERS) e la sindrome respiratoria acuta grave (SARS).

Infine, e forse la migliore notizia del rapporto , non si prevede che si evolva spontaneamente in una forma più mortale , poiché non ha alcuna pressione di evolversi a causa della sua natura iper-virulenta.

Leggi il resto del rapporto qui .

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