Negli ultimi giorni, la stampa mainstream ha respinto con forza contro una teoria sulle origini del coronavirus che ora ha infettato oltre 70.000 persone nella sola Wuhan (a seconda di chi credi). La teoria è che la Cina abbia ottenuto il coronavirus attraverso un programma di ricerca canadese e abbia iniziato a trasformarlo in un'arma biologica presso l'Istituto di virologia di Wuhan. Il politifatto ha puntato il dito contro Zero Hedge, in particolare, sebbene la storia sia stata ampiamente condivisa da media indipendenti.
La teoria è che il virus, che è stato sviluppato da esperti in malattie infettive per funzionare come una bio-arma, è nato nel laboratorio con sede a Wuhan del Dr. Peng Zhou , il principale ricercatore cinese del sistema immunitario dei pipistrelli, in particolare nel modo in cui i loro sistemi immunitari si adattano alla presenza di virus come il coronavirus e altri virus distruttivi. In qualche modo, il virus è fuggito dal laboratorio e il mercato del pesce di Hunan, dove si presume che il virus abbia avuto origine, è solo uno stratagemma.
Ora, un rispettato epidemiologo che di recente ha preso piede per aver affermato in una minaccia di Twitter che il virus sembrava essere molto più contagioso di quanto si pensasse inizialmente sta sottolineando irregolarità nel genoma del virus che suggerisce che potrebbe essere stato geneticamente modificato ai fini di un'arma, e non solo qualsiasi arma, ma la più mortale di tutte.
In " Strana somiglianza di inserti unici nella proteina del picco 2019-nCoV con HIV-1 gp120 e Gag ", i ricercatori indiani sono sconcertati da segmenti dell'RNA del virus che non hanno alcuna relazione con altri coronavirus come la SARS, e invece sembrano essere più vicini a HIV. Il virus risponde anche al trattamento con farmaci per l'HIV.
Per coloro che hanno poco tempo a disposizione, ecco i principali risultati del documento, che si concentra prima sulla natura unica del 2019-nCoV, quindi osservano quattro sequenze di aminoacidi nel Coronavirus di Wuhan che sono omologhe alle sequenze di aminoacidi nell'HIV1:
Il nostro albero filogenetico di coronavirus a lunghezza intera suggerisce che 2019-nCoV è strettamente correlato al SARS CoV [Fig1].Inoltre, altri studi recenti hanno collegato il 2019-nCoV al SARS CoV. Abbiamo quindi confrontato le sequenze di glicoproteine di picco del 2019-nCoV con quelle del SARS CoV (numero di adesione NCBI: AY390556.1). Su un attento esame dell'allineamento della sequenza abbiamo scoperto che la glicoproteina con spike 2019-nCoV contiene 4 inserzioni [Fig.2]. Per indagare ulteriormente se questi inserti sono presenti in qualsiasi altro virus corona, abbiamo eseguito un allineamento di sequenze multiple delle sequenze di amminoacidi glicoproteina spike di tutti i coronavirus disponibili (n = 55) [fare riferimento a Tabella S.1] in NCBI refseq (ncbi.nlm .nih.gov) include una sequenza di 2019-nCoV [Fig.S1]. Abbiamo scoperto che questi 4 inserimenti [inserti 1, 2, 3 e 4] sono unici per 2019-nCoV e non sono presenti in altri coronavirus analizzati. Un altro gruppo cinese ha documentato tre inserzioni confrontando un minor numero di sequenze di glicoproteine con spike di coronavirus. Un altro gruppo cinese ha documentato tre inserzioni confrontando un minor numero di sequenze di glicoproteine di spike di coronavirus (Zhou et al., 2020).Abbiamo quindi tradotto il genoma allineato e abbiamo scoperto che questi inserti sono presenti in tutti i virus Wuhan 2019-nCoV ad eccezione del virus 2019-nCoV di Bat come host [Fig.S4]. Incuriositi dai 4 inserti altamente conservati esclusivi di 2019-nCoV, volevamo capire la loro origine. A tale scopo, abbiamo utilizzato l'allineamento locale 2019-nCoV con ciascun inserto come query contro tutti i genomi dei virus e considerato hit con una copertura della sequenza del 100%. Sorprendentemente, ciascuno dei quattro inserti si è allineato con brevi segmenti delle proteine Human Immunficiency Virus-1 (HIV-1) . Le posizioni degli aminoacidi degli inserti nel 2019-nCoV e i corrispondenti residui in HIV-1 gp120 e HIV-1 Gag sono mostrati nella Tabella 1.I primi 3 inserti (inserire 1,2 e 3) allineati a brevi segmenti di residui di aminoacidi nell'HIV-1 gp120. L'inserto 4 allineato al bavaglio dell'HIV-1. L'inserto 1 (6 residui di amminoacidi) e l'inserto 2 (6 residui di amminoacidi) nella glicoproteina spike del 2019-nCoV sono identici al 100% ai residui mappati sull'HIV-1 gp120. L'inserto 3 (12 residui di amminoacidi) nel 2019- nCoV è mappato all'HIV-1 gp120 con lacune [vedi tabella 1]. L'inserto 4 (8 residui di aminoacidi) è mappato al bavaglio dell'HIV-1 con lacune.
Perché gli autori pensano che il virus possa essere creato dall'uomo? Perché quando si osservano gli inserimenti di cui sopra che non sono presenti in nessuna delle famiglie di coronavirus più vicine, "è abbastanza improbabile che un virus abbia acquisito inserimenti così unici naturalmente in un breve periodo di tempo". Invece, possono essere trovati nell'identificazione delle cellule e nelle proteine leganti la membrana situate nel genoma dell'HIV.
Poiché la proteina S del 2019-nCoV condivide la più vicina origine con SARS GZ02, la codifica in sequenza per le proteine di picco di questi due virus è stata confrontata utilizzando il software MultiAlin. Abbiamo trovato quattro nuovi inserimenti nella proteina del 2019-nCoV- “GTNGTKR” (IS1), “HKNNKS” (IS2), “GDSSSG” (IS3) e “QTNSPRRA” (IS4) (Figura 2). Con nostra sorpresa, questi inserimenti di sequenza non erano solo assenti nella proteina S della SARS, ma non sono stati osservati in nessun altro membro della famiglia dei Coronaviridae (figura supplementare). Ciò è sorprendente poiché è abbastanza improbabile che un virus abbia acquisito inserimenti così unici naturalmente in un breve periodo di tempo.È stato osservato che gli inserimenti sono presenti in tutte le sequenze genomiche del virus 2019-nCoV disponibili dai recenti isolati clinici. Per conoscere l'origine di questi inserimenti nel 2019-nCoV è stato fatto un allineamento locale con BLASTp usando questi inserimenti come query con tutto il genoma del virus. Inaspettatamente, tutte le inserzioni sono state allineate con il virus dell'immunodeficienza umana-1 (HIV-1). Ulteriori analisi hanno rivelato che sequenze allineate di HIV-1 con 2019-nCoV sono state derivate dalla glicoproteina di superficie gp120 (posizioni di sequenza degli aminoacidi: 404-409, 462-467, 136-150) e dalla proteina Gag (366-384 aminoacido) ( Tabella 1).La proteina gag dell'HIV è coinvolta nel legame con la membrana ospite, nel confezionamento del virus e nella formazione di particelle simili al virus. Gp120 svolge un ruolo cruciale nel riconoscere la cellula ospite legandosi al recettore primario CD4. Questo legame induce riarrangiamenti strutturali in GP120, creando un sito di legame ad alta affinità per un co-recettore delle chemochine come CXCR4 e / o CCR5.
E alcuni elementi visivi, che portano gli autori della carta a concludere che "questo cambiamento strutturale potrebbe anche aver aumentato la gamma di cellule ospiti che 2019-nCoV può infettare" :
La modellazione 3D della struttura proteica ha mostrato che questi inserimenti sono presenti nel sito di legame di 2019-nCoV. A causa della presenza di motivi gp120 nella glicoproteina spike 2019-nCoV nel suo dominio di legame, proponiamo che questi inserimenti di motivi potrebbero aver fornito una maggiore affinità con i recettori delle cellule ospiti. Inoltre, questo cambiamento strutturale potrebbe anche aver aumentato l'intervallo di cellule ospiti che 2019-nCoV può infettare . Per quanto ne sappiamo, la funzione di questi motivi non è ancora chiara nell'HIV e deve essere esplorata. Lo scambio di materiale genetico tra i virus è ben noto e tale scambio critico evidenzia il rischio e la necessità di studiare le relazioni tra famiglie di virus apparentemente non correlate.
Un buon riassunto delle scoperte è stato fornito dal dott. Feigl-Ding, che ha iniziato la sua discussione esplicativa sottolineando che la velocità di trasmissione al di fuori della Cina ha superato quella all'interno della Cina.
2) Whoa- the rate of increase ***outside of China*** is steeper than inside of China or Wuhan! Figure 1A. From: @TheLancet “Nowcasting and forecasting the potential domestic and international spread of 2019-nCoV
”)
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Ma la "pistola fumante" in questo caso sono parti del codice genetico del virus che i ricercatori indiani, guidati da Prashant Pradhan presso l'Indian Institute of Technology, hanno scoperto che potrebbero essere stati "incorporati" dall'HIV, che appartiene a una famiglia di virus completamente diversa .
17. ...WHOA- the authors said the finding was “Unexpectedly” related to genes from HIV virus. Notably there were 4 gene insertions (see figure in above post #16). And so, which HIV gene proteins were found in the new #coronarvirus? Gag protein and Gp120- key HIV proteins...
19. Again, these are new express published findings and not peer reviewed yet. Let’s not draw conclusions yet. But evidence suggest that 2 different HIV genes are present in the #coronarvirus S gene region (that didn’t map to any other coronavirus, according to other studies).
La battuta finale:
9. BOTTOMLINE: 1) Seafood market not the source. 2) This RNA #coronavirus mutates really fast. 3) has unusual middle segment never seen before in any coronavirus. 4) Not from recent mixing. 5) That mystery middle segment encodes protein responsible for entry into host cells.
Un altro dottore intervenne con quella che pensava fosse una solida spiegazione delle irregolarità del virus ...
... Fino a quando non ha realizzato qualcosa di inquietante.
"Spaventoso" ... ma rilassati, è solo un'altra ridicola "cospirazione". Fonte: qui
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